>2: Analyzed DNA methylation file, uncompressed format (the G of a CpG _is_ represented by a '-') Sequence 0 --I------I----------------.---------------0---0---------0---I--------I----I----------I-----------------------------------0--0------I---0---0-------------0--------I-------0----I--------I--I-----------------------0---------0--------0---------------I-- Sequence 1 --I------0----------------.---------------0---I---------I---I--------I----I----------I-----------------------------------0--I------I---I---I-------------I--------I-------0----I--------I--I-----------------------0---------0--------0---------------I-- Sequence 2 --0------I----------------0---------------0---I---------I---I--------I----I----------I-----------------------------------0--0------I---I---I-------------I--------I-------0----I--------I--I-----------------------0---------0--------0---------------I-- Sequence 3 --0------I----------------0---------------I---I---------0---I--------0----I----------I-----------------------------------0--0------0---0---I-------------I--------I-------0----I--------I--I-----------------------0---------0--------0---------------I-- Sequence 4 --0------I----------------0---------------I---0---------0---I--------I----0----------I-----------------------------------I--0------0---I---0-------------0--------I-------I----I--------I--I-----------------------0---------0--------0---------------0-- Sequence 5 --0------I----------------0---------------I---0---------0---0--------0----0----------I-----------------------------------I--0------0---I---0-------------0--------I-------I----I--------I--I-----------------------0---------0--------0---------------0-- Sequence 6 --I------I--------------------------------0---I---------I---0--------I----0----------I-----------------------------------0--0------0---0---0-------------0--------I-------I----I--------I--I-----------------------0---------0--------0---------------0-- Sequence 7 --I------I----------------0---------------0---I---------0---0--------I----0----------I-----------------------------------I--0------0---0---0-------------0--------I-------I----I--------I--I-----------------------0---------0--------0---------------I-- Sequence 8 --I------I----------------0---------------0---0---------I---0--------I----0----------I-----------------------------------0--0------0---0---0-------------0--------I-------I----I--------I--I-----------------------0---------0--------0---------------0--